Regelmäßig nimmt die SUB Göttingen in dem jährlichen bundesweiten Bibliotheksranking BIX in der Kategorie der „zweischichtigen Universitätsbibliotheken” – Bibliothekseinrichtungen, die mehrere Teilbibliotheken umfassen – Spitzenplätze in den Bereichen „Angebote”, „Nutzung” und „Entwicklung” ein. Der Bibliotheksindex BIX wird im Rahmen des Kompetenznetzwerks für Bibliotheken (KNB) vom Deutschen Bibliotheksverband (dbv) und dem Hochschulbibliothekszentrum des Landes Nordrhein-Westfalen (hbz) durchgeführt. Er wurde im Jahr 2000 erstmals publiziert und gilt als maßgebliches deutsches Bibliotheksranking.

2008 wurde die SUB Göttingen als Ort der Ideen ausgewählt. Sie gehörte so zu den Siegern eines bundesweiten Wettbewerbs für die Veranstaltungsreihe „365 Orte im Land der Ideen“. Gewürdigt wurden damit die vielfältigen Aktivitäten der SUB Göttingen als Kompetenzzentrum für die Digitale Bibliothek. Der Wettbewerb „365 Orte im Land der Ideen“ ist ein Projekt der Standortinitiative „Deutschland – Land der Ideen“.

2002 erhielt die SUB Göttingen die Auszeichnung „Bibliothek des Jahres“. Dieser einzige deutsche nationale Bibliothekspreis wird alljährlich vom Deutschen Bibliotheksverband (dbv) und der ZEIT-Stiftung Ebelin und Gerd Bucerius verliehen. Die Preisgeber würdigten besonders „die impuls- und beispielgebende kooperative Zusammenarbeit zur Verbesserung der Leistungsfähigkeit der Bibliotheken in Deutschland, die erfolgreiche Mitwirkung an internationalen Projekten und die hervorragende Leistung, das historische Erbe und die moderne Technik so innovativ zu verknüpfen, dass multimediale Dienstleistungen für Nutzer geschaffen werden können“.