Der überwiegende Teil der Handschriften der SUB Göttingen ist in einem gedruckten Katalog (digitale Fassung) verzeichnet: 

• Die Handschriften in Göttingen / Hrsg. von Wilhelm Meyer. Bd. 1: Universitätsbibliothek. Philologie, Literärgeschichte, Philosophie, Jurisprudenz. Berlin :  Bath, 1893. (Verzeichniss der Handschriften im preußischen Staate 1, Hannover, 1)
• Die Handschriften in Göttingen / Hrsg. von Wilhelm Meyer. Bd. 2: Universitätsbibliothek. Geschichte, Karten, Naturwissenschaften, Theologie, Handschriften aus Lüneburg.  Berlin :  Bath, 1893. (Verzeichniss der Handschriften im preußischen Staate 1, Hannover, 2)
• Die Handschriften in Göttingen / Hrsg. von Wilhelm Meyer. Bd. 3: Universitätsbibliothek. Nachlässe von Gelehrten, Orientalische Handschriften. Handschriften im Besitz von Instituten und Behörden. Register zu Band 1 - 3.  Berlin :  Bath, 1894. (Verzeichniss der Handschriften im preußischen Staate 1, Hannover, 3)
• Die Handschriften der Niedersächsischen Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen: Neuzugänge 1894-1966 / Bearb. von Irmgard Fischer. Wiesbaden : Harrassowiz, 1968

Standort des Dienstexemplars mit zahlreichen handschriftlichen Ergänzungen:
HSD-LS (Abteilung Handschriften und Seltene Drucke - Lesesaal). Systemstelle: Yd 512/c

Darüber hinaus existieren verschiedene interne Verzeichnisse sowie eine Autographenkartei.

Seit April 2017 beteiligt sich die SUB Göttingen an der Verbunddatenbank KALLIOPE der Staatsbibliothek zu Berlin - Preußischer Kulturbesitz.

Von Oktober 1997 bis März 2017 wurden Nachlässe und laufende Neuzugänge in der Datenbank HANS erfasst. Die Datensätze aus der HANS-Datenbank wurden in das KALLIOPE-Portal überführt.

Das Handschriftenportal bietet Zugang zu den Ergebnissen der Handschriftenkatalogisierung im deutschen Sprachraum.